Japfa đầu tư vào Việt Nam năm 1996 bằng hình thức liên doanh với Tổng Công ty Chăn nuôi Việt Nam, sau 03 năm liên doanh với mục tiêu phát triển lớn mạnh tại thị trường Việt Nam, tới năm 1999 trở thành Công ty 100% vốn đầu tư nước ngoài với tên gọi Công ty TNHH Japfa Comfeed Việt Nam, có Trụ sở chính và Nhà máy chế biến thức ăn chăn nuôi đóng tại thị trấn Hương Canh, huyện Bình Xuyên, tỉnh Vĩnh Phúc.
Năm 2005 Công ty TNHH Japfa Comfeed Việt Nam tiếp tục mở rộng, đầu tư các hoạt động kinh doanh vào miền nam Việt Nam và thành lập thêm Công ty mang tên Công ty TNHH Japfa Comfeed Long An, có Trụ sở chính tại xã Nhựt Chánh, huyện Bến Lức, tỉnh Long An.
Năm 2010 tiếp tục mở rộng và thành lập Công ty TNHH Japfa Comfeed Bình Thuận, có Trụ sở tại xã Đông Hà, huyện Đức Linh, tỉnh Bình Thuận.
Năm 2012, Công ty TNHH Di truyền giống Japfa Hypor được thành lập, trụ sở tại xã Minh Tâm, huyện Hớn Quản, tỉnh Bình Phước. Japfa Hypor là liên doanh giữa Công ty TNHH Japfa Comfeed Long An và Công ty Hypor B.V – Hà Lan, hoạt động trong lĩnh vực di truyền giống heo và cung cấp heo giống cho thị trường Việt Nam.
Tại Việt Nam, Japfa đang là một trong ba công ty lớn nhất có mô hình chăn nuôi khép kín với một danh mục sản phẩm chất lượng và đa dạng.
Japfa Việt Nam liên tiếp nằm trong top 500 doanh nghiệp lớn nhất Việt Nam, top 1000 doanh nghiệp đóng thuế nhiều nhất Việt Nam kể từ năm 2010.
Xác định nguồn lực con người là trung tâm của sự phát triển, ở Japfa Comfeed Việt Nam, chúng tôi tự hào là nơi hội tụ của hơn 4000 cá nhân tích cực, giàu kinh nghiệm, nhiệt tình trong công việc, cùng nhau cống hiến xây dựng Japfa Việt Nam xứng tầm khu vực, khẳng định vị thế trên thương trường.
Mang trong mình sứ mệnh “Hợp Tác Vì Sự Thịnh Vượng Chung”, Japfa luôn đặt mình vào vị trí của đối tác, khách hàng để tạo nên một môi trường kinh doanh thuận lợi, góp phần vào công cuộc xây dựng và phát triển ngành chăn nuôi của Việt Nam.